微生物肥料的分类从微生物肥料的组成不同，可分为3类：微生物菌剂、复合微生物肥料和生物有机肥三类。配合微生物繁殖的场所：微生物肥料是活菌，施入土壤后需要繁殖生存，其中最佳生存之处是根圈，因此施在根上的效果最佳，若微生物肥料在稀释液中添加少量腐植酸、糖蜜或营养剂，将有助于微生物的繁殖及生存。
微生物肥料是大家目前经常接触到的一种肥料，那么微生物肥料究竟有什么作用？有哪些分类？如何才能达到更好的效果？今天我们就来聊一聊微生物肥料的话题。微生物肥可兼具肥料与抗病的功能，前者主要是增加营养来源（例如固氮、加速有机质分解）、有效性（溶解被固定的磷、钙、镁等），及促进吸收的作用；后者则是根圈保护的作用。
微生物肥料是以土壤有益菌的概念采用“人海战术”的方法，将大量有益微生物施用于根圈内，借由竞争养分的原理，抑制有害微生物的族群而产生拮抗的作用。微生物肥料的分类从微生物肥料的组成不同，可分为3类：微生物菌剂、复合微生物肥料和生物有机肥三类。按照微生物的功能不同又可分为以下6类：固氮菌：分为共生型、协生型和非共生型三类，前者如豆科植物的根瘤固氮菌，固氮量高；后者属游离性固氮菌，固氮效率差。
溶磷菌：可溶解土壤中不易溶性的结合磷，如磷酸铁、磷酸铝（酸性土壤）和磷酸钙（碱性土壤）。菌根菌：增进根系吸收磷素，可抗旱、抗病。分解菌：促进有机物的分解，提供作物养分。聚合物分泌菌：分泌多醣类，增进土壤团粒。生长激素合成菌：分泌生长激素，增进作物生长。如何使用微生物肥料微生物肥料的使用方法很方便，只要将种子、作物根部或小苗直接与接种剂充分接触即可。
一般微生物肥料的剂型可分为液体和固体，液体者可采用幼苗接种法、种子接种法、以及种植后的接种法或直接灌入土壤中的方法施用，固体者则以幼苗接种法与种子接种法施用。而为了使微生物肥料发挥最大的功效，必须注意以下事项：土壤不能太酸或太碱：土壤pH小于5或大于7.8均影响各种营养的吸收及有效性，对于微生物肥料的发挥将受到限制。
因此土壤pH值若太高或太低，须先作改良。配合微生物繁殖的场所：微生物肥料是活菌，施入土壤后需要繁殖生存，其中最佳生存之处是根圈，因此施在根上的效果最佳，若微生物肥料在稀释液中添加少量腐植酸、糖蜜或营养剂，将有助于微生物的繁殖及生存。配合作物的需求：各种作物在不同生长期中对不同微生物肥料的需求要配合，微生物肥料的接种愈早愈好，以幼苗接种最有效。
若多年生果树则在生长期重视增进氮及磷功能的菌种，中果期则重视增进磷功能的菌种。微生物肥料的品质要求：微生物肥料是活菌，因此，接种剂的品质要求菌数要维持，菌的活性要高，要能适应本土环境及杂菌要少的要求。微生物接种剂的保存方法及注意事项如下：低温保存阴凉处保存避免与有毒的农药混合使用，特别是杀菌剂。微生物接种剂的品质要求如下：菌数要多菌的活性要高适应性要高杂菌及杂质要少总之，从事种植的朋友就是要和土壤及作物做朋友，充分了解土壤和作物的特性，才能作正确的肥培管理。
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