NEO首次登场是在2010年主线，确切是赛尔号和海盗唯一一次开战型的主线。海盗举旗进攻赛尔号，而赛尔号也陷入了危机。它们没有了退路，只要成功击破赛尔号，海盗也就算是成功了。2009-2010：初始三主宠，也是赛尔号第一版本的三主宠，和《口袋妖怪》御三家一样，都是以水、火、草三个互相克制的属性为基础所延续的一个基本游戏开始。
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赛尔号中，除了混沌教派、大暗黑天之外还有什么比它们更强的神秘组织？
海盗组织：海盗首领（老大）NEO，宇宙海盗的头目，设定上是赛尔号海盗最大的反派，而且曾经和罗杰都有过大战。但是在赛尔号的整个历程上，他只出现了一次。首先我们先科普一下等级，既然已经是认定了的大BOSS。那么最低也是元帅等级，以下还有将官设置:大将、上将、中将、少将（中国军衔）。而现在从最近的中将艾伯、中将巴罗的实力来看，这个老大的登场会留在最后。
单凭一个巴罗就能打的贾斯汀一行人天旋地转，就更不用说今后出现的上将实力了。NEO首次登场是在2010年主线，确切是赛尔号和海盗唯一一次开战型的主线。海盗举旗进攻赛尔号，而赛尔号也陷入了危机。在攻破了蝎子号、犀牛号之后，主舰幽灵号就待的是海盗首脑。在“决战幽灵号”中，贾斯汀复活之后赛尔号全面进行反攻。NEO出场，它的出场颠覆了海盗这个搞笑团体，不再是打了就一定赢，任何时候赛尔号都不吃亏。
瞬间出手就秒杀了好几个士兵，贾斯汀出手。势均力敌，平分秋色，谁也占不到好处（贾斯汀当时的设定有200万战斗力）。接着艾里逊想要偷袭的时候雷伊盖亚登场，阻止了艾里逊。NEO让佐格向赛尔号开炮，这时候雷伊盖亚拖住了NEO，现在想想，一个机器人能以一己之力力敌当时两大巅峰精灵，可见有么厉害。而从雷伊的“我们来拖住它”就能看得出来，它们二人也是吃不准能拿下这个海盗老大。
就在这个时间段，贾斯汀放出了他的“六剑齐发”拦截幽灵号炮台。NEO分出神让迪恩顶住，它让迪恩来顶住，就是知道迪恩有那个实力，当然，迪恩当时的确是有着能跟站长五五开的水平。唯一让它失策了的，就是迪恩的反叛。如果迪恩当时挡住了贾斯汀，炮台发射成功，赛尔号重创。它们没有了退路，只要成功击破赛尔号，海盗也就算是成功了。
迪恩没有挡攻击让战局失衡，NEO撤退。此次大战是NEO输在了迪恩这个多重间谍的手上。最后海盗主线落幕的时候，“你以为你们这样就能捉住我吗？呵呵！相信我们很快就会见面的！今天的一切！我一定会讨回来！”——NEO。等到它这个王牌登场的时候，不知道又会拿着怎样颠覆宇宙的实力再次出到我们的面前。创世之神：创世六神兵、创世兵魂、奥斯卡的主宰。
创世六神兵是我们接触最多的一个，它们的实力要弱于神域四天王，但是后期的时候有所提升。后来创世兵魂融合后重生再给创世精灵这一族又添了新的战力，爆发后的创世兵魂实力更是强劲。比起监管者奥斯卡强的不是一星半点，主线走到更强大、更远古的时期。唤醒索伦森、谱尼、奥斯卡、幽灵血手阿斯狄等一系列无间境地的存在。后来化解了泰坦星系的危机之后沉寂，直到永恒之树受到影响的时候它再次出现。
在魔灵王·斯摩亚蒂重新复苏之后，抽取了永恒之树的能量，将史莱姆国王也混沌化了。它感受到了魔灵王的意图之后，开始做起了防御措施。在魔灵王到达永恒星的那一刻，创世兵魂就已经知道它此行的目的是“创世之钟”了。在完全突破的情况下，依旧还是抵抗不了得到逝者巨樽的魔灵王，最后引爆永恒星重创魔灵王。创世所有直系精灵落幕，唯独一开始就挂在嘴边的“传世之神”到现在也没有出现。
而从谱尼、魔灵王这些骨灰级的存在就能多多少少知道，创世之神并非只有这么简单。如果这样盘算创世之神的力量程度，最起码它也是有着年费至尊实力的。邪灵组织：威斯克所在的组织。威斯克直到最后一刻还在阻止谱尼和这些凡域的精灵进入第六星系，它也是组织中的一颗棋子而已。而它深知邪灵组织有多么厉害，才会如此执着。从它和大暗黑天、奥古斯特的野心就能看出来它不是一般人。
在整个大暗黑天，论精灵手下，最多的是它，玩的最大的也是它，如果不是谱尼、奥斯卡、迈尔斯同时站在一起，可能它还会想着背水一战。上古时期就占据了一席之地称霸一方，后来不知道什么原因来到凡域，杀了布莱克一家。最后布莱克一家只剩下它和它的叔叔（斯摩亚蒂），两人各自流落。布莱克则是通过索兰特加入了邪灵组织，后来蛰伏在威斯克手下做了二当家。
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