细菌、病毒、病原体和真菌是人体内常见的微生物。人体内有许多微生物，其中一些是有益的，如大肠中的大肠杆菌，它可以分解消化后的食物残渣。人体内常见的微生物有三组(不包括皮肤表面的微生物):一、鼻子、口腔微生物群，鼻子和口腔内的细菌可能与感冒、口腔疾病、龋齿，甚至带状疱疹、肾炎都有一定的关系。
人体内微生物有哪些？
很多人不知道，人体内、外存在大量的微生物，其数量远远超过人体细胞的数量。人体内的微生物常见的有细菌、病毒、病原体及真菌等。其中细菌按不同分类，可以有革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌；需氧菌、厌氧菌；有益菌、有害菌、机会致病菌等等。而且人体内庞大的微生物形成菌群，个细菌种类数量及致病性等达成平衡，对身体健康起到至关重要的作用。
人体内微生物常见的有三大群（不包括皮肤表层的微生物）：一、鼻、口腔微生物群鼻、口腔内的细菌与感冒、口腔疾病、龋齿、甚至带状疱疹、肾炎等都可能存在一定的关系。口腔微生物包括细菌，真菌和病毒,其中细菌为最主要的类型。口腔的常见细菌包括：革兰阳性菌属、如葡萄球菌和微球菌,乳杆菌属、放线菌、罗氏菌属、丝杆菌属、双歧杆菌、丙酸菌属等；革兰阴性菌如韦永菌、奈瑟菌属，类杆菌属、梭状杆菌属、纤毛菌属、沃廉菌属、弯曲杆菌属等；其他微生物还包括螺旋体属，支原体，真菌，病毒，原虫等。
二、消化道微生物群消化道内微生物与人体的生理功能调控、营养物质吸收及肥胖甚至糖尿病等都有一定的关系。消化道中许多微生物是有益的，它们帮助人体处理复杂的化合物，还可以生成氨基酸和维生素。胃内的幽门螺杆菌是形成胃炎及消化道溃疡的元凶之一。肠道菌群依据在肠道内的分布层次和存在情况，可以将其分为膜菌群和腔菌群两大类：膜菌群又称为原籍菌，在出生后数天就能贴近黏膜表面定植，是长期居住的细菌，成年时仍保持较多数量，与定植部位的上皮有密切联系，如双歧杆菌、厌氧乳杆菌、拟杆菌等；腔菌群又称外籍菌，主要存在于肠腔内，是数量少、不稳定的过路菌，如铜绿假单胞菌、肠球菌、大肠杆菌等。
微生物的体内还有没有更小的微生物？
我们可以先了解一下高级生命的层次结构：细胞—组织—器官—系统—个体，也就是说高级生命是一个多细胞生物，既然有多细胞生物，就有单细胞生物，就如微生物。微生物又可分为细菌和真菌和病毒三大类，其中病毒一般是最小的，可寄宿在细菌和真菌或者高级生命比如人。单细胞生物有个很好的特点就是繁殖速度快，容易生存。人体内就有很多微生物，有些还是有益的，比如大肠内的大肠杆菌，可以分解人消化过后的食物残渣。
都说人体内有微生物，你信吗，我肉都发麻了？
人体内外微生物数量比人体细胞还要多得多，也就是人类肉眼看不见微生物，要不然会把自己恶心死，而那些微生物实际上还协助人体消化、免疫等重要功能，不可或缺。微生物在自然界生存的优势就是体型很小，肉眼看不到，而大型动物必然要和外界发生物质和能量的交换，也就是要吃要喝，所以无可避免地摄入微生物，但是微生物如果泛滥的话会造成动物的死亡，所以在进化的过程中微生物和大型动物逐渐“共生”，人体为微生物提供能量，微生物协助人体进行一些生理功能。
寄居在人体上的微生物绝大多数对人体无害，人体细胞有60万亿左右，而微生物的数量却远远高于此，可能有10倍，但有害的只是少数，在数量和种类上也不占优势，所以别听到人身上遍布微生物就犯了洁癖，没必要，实际上那些微生物就是靠人体的机能蹭点吃喝罢了，但是反过来也帮助人体更好地适应环境。人体内的微生物对人重要的方面主要是两个：免疫和消化。
免疫人体皮肤乃至组织间隙中都有微生物的存在，在人的生长发育过程中，随着免疫系统的发育，逐渐和微生物达成一种较为和谐的状态，那就是你不犯我我不犯你，微生物的种类和数量保持相对恒定。一旦人体有外来的微生物侵袭，这些寄居在人体的微生物就因为能量的摄取而和外来的有害微生物产生竞争，影响外来微生物的生存，甚至能在竞争中把外来微生物的吃的喝的都抢光，使它们无法生存，这就无形中增强了人体的免疫。
但是这个系统偶尔会出现问题，就是菌群失调。皮山菌群失调可导致皮肤病，胃肠道菌群失调可导致腹泻或便秘。但当微生物在人体内游荡时，会偶尔走错地方，被免疫系统清除，这也能增加免疫系统的活性。在人体消化的过程中，由于食物的变化，肠道内微生物的种类也在不断变化，可消化食物的种类也在变化。人体大肠的结构由草食缩短为杂食，大肠本身没有重要的消化功能，降低了消化植物性食物的能力。它的主要功能是储存食物残渣，但生活在肠道内的微生物可以帮助人体消化一些富含纤维的食物。食物残渣中的一些不易消化或不干净的糖类可以发酵产生短链脂肪酸，作为肠道上皮细胞的能量来源。微生物消化食物残渣产生多种维生素，如维生素B和维生素K，它们需要的只是能量。
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