这时候，南疆的首领们看北疆有变，也开始不安分，并将清廷派往南疆招抚的托伦泰扣押。兆惠请示乾隆后，派遣副都统阿敏道，率领一千余人，降服了乌什附近的叛军，而且探听到托伦泰的消息。南疆的小和桌看清军来势汹汹，赶紧送还了托伦泰。之后，兆惠看出了小和桌的背叛意图，暗中派遣阿敏道火速出兵。乾隆二十一年冬，准噶尔叛军围攻伊犁。
此时的伊犁，已经是一座孤城，兆惠只好带领人马撤退。但在撤退途中，准噶尔叛军穷追不舍，很快将兆惠包围。兆惠想突围，无奈寡不敌众，只好派出一小队人马，由主力掩护突围。突围出去的人，马不停蹄，找到了巴里坤办事大臣雅尔哈善，要求救援。雅尔哈哈派侍卫图伦楚带人，去营救兆惠。就在这时，围攻兆惠的准噶尔叛军，突然出现天花，战斗力大减，在援军到来之时，已经撤兵。
兆惠联合救援军队，迅速追击叛军。不过，受制于粮饷不足，追了几天就鸣金收兵。乾隆二十二年，朝廷命令成衮札布、兆惠兵分两路，大力围剿准噶尔部。大军在行进的过程中，一部分兵丁留下负责屯垦，另外又招收一批当地士兵。如此，既解决了军粮问题，又截断了准噶尔的退路。准噶尔地区大面积流行天花，还爆发内乱，在清军面前已经不堪一击，因此，兆惠可以长驱直入，基本上没遇到有效抵抗。
阿睦尔撒纳在清军的追缴下，仓皇出逃，躲到哈萨克。兆惠马上派人同哈萨克交涉，要求对方协助清军抓捕阿睦尔撒纳。哈萨克已经向清廷“遣使入贡”，答应帮忙。哈萨克人扣住阿睦尔撒纳的马匹，灵敏的阿睦尔撒纳一看情况不对，便赶紧向北逃入俄罗斯。俄罗斯人收留了阿睦尔撒纳，但他运气不好，没过多久就患上天花去世。后来，俄国人看他已经去世，也失去利用价值，就将其遗体交还清廷。
乾隆命令兆惠不要撤军，就地驻守，等过冬之后，再对阿睦尔撒纳的残余势力进行追剿。乾隆二十三年，兆惠包围叛军剩余力量，进行地毯式搜索。不管是穷乡僻壤还是沿河谷地，对数十万人搜了个遍，只要是叛乱分子，全部正法。前前后后，清军又花了四年时间，才彻底根除准噶尔叛军。事后，朝廷设满洲兵驻防，并调绿营兵屯田。乾隆二十七年，朝廷设置伊犁将军，自此，准噶尔部成了清朝移民实边的地区。
秋媚说：兆惠能在短时间之内，彻底平定准噶尔，与两个“天时”有很大关联，一是因为前面几位将领已经重创了准噶尔，兆惠接手时，“菜”已经快熟了；二是因为准噶尔的天花、内乱，进一步消耗自身力量，让本已经受损的部落雪上加霜。当然，兆惠本人的能力也不容小觑，不仅战争意志坚定，被围剿也不投降，而且战术的运用也有相当的灵活性。
中国古代皇帝是怎么处理政务的？是天天上班，还是有休班的日子？
皇帝作为一国之主，万民之所系，自然责任甚重。他们的愚智勤惰对于国家的发展有着重要的影响。有的皇帝勤政苦干，如雍正皇帝，日夜批阅奏折，最终将自己累死；有的皇帝深居后宫，如嘉靖皇帝，只知炼丹修仙，最终将自己毒死。作为至高无上的皇帝，他们上班、休班是没有严格规定的，完全凭他们的喜好。尽管对于皇帝上朝接见大臣之事，历朝历代都有详细规定，但能否切实执行，这都得看皇帝的心情了。
满清灭亡后，努尔哈赤以后的十一位皇帝齐聚阴间，努尔哈赤首先会抽谁？
清朝皇帝齐聚阴间，开国皇帝努尔哈赤坐在前面，一圈围着的是清朝十一个皇帝。大清彻底灭亡的消息传到了地府，努尔哈赤一听说这个消息，非常愤怒，怒目圆睁，看着自己的十一个后代，火气就上来了！努尔哈赤（捶足顿胸）：我大清终究还是完了啊，我金人的天下就这么被夺走了，你们这帮没用的后人，谁来领罪！皇太极：皇阿玛，您别生气，当心气坏了身子。
您说的不对，这大清帝国是我建立的，这个气得让我来生才是！努尔哈赤：我最喜欢的多尔衮呢，你抢了他的皇位，才是导致大清灭亡的根本原因！皇太极：回皇阿玛，十四弟在我死后霸占了我媳妇孝庄，让我儿子福临喊他爸爸，这样也算把皇位交还给他了。顺治帝：爸爸，您怎么能这么说呢，我只有您一个爸爸啊。十四叔想要皇位我给他就是了，他根本不在乎皇位，他在乎的是我妈。
努尔哈赤：福临，你说说你，好好的皇帝不当，非要去五台山去当和尚，真是气煞我也！康熙：太爷爷，您别怪我爸爸，他这是用情至深的结果。我继位之后，擒鳌拜，平三藩，收复台湾，政治经济文化共同发展，建立了强大的康熙王朝，也一样没给大清朝丢脸。努尔哈赤：你说得倒是挺厉害，你选择继承人时爆发的九子夺嫡事件可是让大清王朝饱受苦难啊！雍正：回老祖宗，历史就是这样，会让该胜出的人胜出！努尔哈赤：胤禛，你也是做了青天白日梦了，一天到晚把命扑在朝政上，最后撑不下去了，居然想着炼丹续命，那玩意儿能吃吗？前朝嘉靖皇帝怎么死的，不知道吗？乾隆：是啊，爸爸。
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