值税电子专用发票和纸质增值税专用发票在抵扣和勾选上有什么不同?应如何进行勾选?纸质增值税专用发票和增值税电子专用发票二者的抵扣和勾选在系统中的流程、功能均相同。进行增值税电子专用发票抵扣勾选：纳税人登录增值税发票综合服务平台,通过"抵扣勾选"模块,选择"增值税电子专用发票"类型,可以直接查询到符合勾选抵扣条件的发票,直接进行勾选操作即可。
如何确认增值税专用发票已被抵扣？
如果你是开票方想确认对方是否抵扣目前的技术手段还不能，只能和对方打电话确认。如果是收票方，第一种办法比较笨，去税局大厅比对，完后税局可以给你一个证明，我们邯郸这里税局主动提供。第二种方法用航信软件认证，方法也比较老了，同样是从软件中调抵扣记录，不会可以给航信客服打电话。服务超级到位。第三通过网络勾选认证，纳税等级高的企业可以。
善意取得虚开增值税专用发票已抵扣,查补增值税不予加收滞纳金!国家税务总局盐城市税务局稽查局税务处理决定书盐税稽处〔2021〕78号盐城市***物资有限公司：（纳税人识别号：32090***500606）我局于2013年8月8日至2016年12月5日对你（单位）2011年1月1日至2013年7月31日增值税情况进行了检查。
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