考古人员对第一层和第二层进行了发掘，在第一层出土了牛、羊、狗等陪葬动物骸骨700多具，在第二层出土了大量东罗马金币、波斯银币、古藏文简牍、金银器、铜器残片和丝绸物品，尤其是丝绸品品种全、图案精美。大墓前方发现了5条“葬马沟”，出土了87匹马的完成骨架，奇怪的是，第一、二层所有的墓室内都没有发现人骨和丧葬有关的棺椁之类葬具，难道这个大墓真的有传说中的九层？但是，考古学家只发觉了两层就停止发掘了，并不是出现了什么奇怪的现象，主要是因为这两层破坏严重，而后面的几层由于没有盗墓贼光顾，为了不破坏古墓，国家对其进行了专门的保护，没有进行进一步的发掘工作。
目前国家对古墓的发掘通常都是抢救式发掘，一般不主动发掘，尤其是帝王级别的墓葬更是以保护为主，当年定陵发掘的教训太深刻了。除了对文物的保护，还有安全方面的考虑，这座古墓非常深，越往下作业，危险系数越高，而且墓道入口非常狭窄，层与层之间没有通道，考古人员必须用绳子吊着进入，越往下越让人感到压抑，在里面常常有头痛欲裂的感觉，发掘难度非常大。
有人说有些专家不敢深入研究三星堆，这是为什么？
不敢深入研究三星堆文化？关键是能力不足！三星堆文化从发现的那一天起，便引发了中国以及世界的考古学家和中国古文学家的兴趣和研究，从1933年至1986年之间，虽然前前后后历经了几次的科学发掘，三星堆文化的内容也越来越丰富，越来越完整的呈现在我们面前，但是对于三星堆文化的研究一直没有很大的突破和进展。时至今日，我们对于三星堆文化和中原的夏商文化之间的关系，依然处于一种猜测的阶段。
三星堆文化和二里头文化究竟有没有关联性和交流，依然没有定论。三星堆文化是位于我国西蜀地区的土著文化，被认为是古蜀文化的源头，不仅历史悠久，涉及领域广泛，文化成果璀璨，而且最重要的一点是，三星堆文化是一种不同于中原文化的土著文化。以至于很多人认为三星堆文化是一种外来文化，乃至于是由外星人曾经造访地球时创造的文明。
正是三星堆文化的特殊性和独具特色。再加上三星堆文化历史年代久远且没有很好的保留延续传承到今天，因而使得研究三星堆文化显得十分的困难。从1933年至今，三星堆文化的研究一直都没有停止过。但是研究成果却没有得出十分有力的证据和定论。而且三星堆文化晦涩难懂的文明形式神像塑像面具等，没有留下任何的文字说明和记载，而且也没有现行的古蜀文明可供参考，因此也使得很多对中原文化有研究的考古工作者们很难利用自己的所学而去从事三星堆文化的研究。
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