在连连胜利之下，燕军士气更加旺盛，一鼓作气向东北追歼东胡。抵抗无用，一直退却到千余里外的今西辽河上游。东胡向北退却逃遁，燕国北境大展，号称拓地“千余里”。燕军又乘胜东击辽水一带的箕子朝鲜，夺取了辽东的广大地区，极边甚至伸过今鸭绿江以南。“直至满番汗为界”——燕国的边界由此一直推进到今天朝鲜半岛鸭绿江以南的清川江流域一带。
秦始皇嬴政一统华夏之后废分封行郡县——将全国上下划分为三十六郡，其中辽西、辽东两郡就位于今天东北三省中的辽宁省境内。此后历经两汉、曹魏、西晋等朝代中原王朝一直对辽西、辽东两郡进行着行之有效的管辖。只是在经历五胡乱华和南北朝的分裂对峙后辽西、辽东地区落入割据政权高句丽之手。唐代灭高句丽后进一步扩张了中原王朝对东北的影响：秦汉时期的辽西、辽东两郡只延伸到今天辽宁省境内，至于更加偏北的吉林和黑龙江两省在当时还基本上是蛮荒之地。
唐代在东北设置有安东都护府、室韦都督府、黑水都督府、渤海都督府等行政管辖机构，唐帝国的国境线一直向北延伸到了今天俄罗斯境内的外兴安岭一带。这一时期唐朝还开辟了由东北地区通向新罗、日本以及今天勘察加半岛一带的东北亚海上丝绸之路。随着李唐王朝由盛转衰逐渐形成了藩镇割据的现象，而这些边陲地区的都督府大多原本就是册封当地部族酋长治理的，此时渤海都督府逐渐脱离李唐王朝的控制成为独立的渤海国。
公元926年渤海国被新兴的契丹国所灭，契丹则在逐渐汉化后形成了同北宋对峙的大辽王朝，至此东北地区又处于辽帝国的统治之下。1114年生活在混同江（今松花江）流域的女真完颜部在首领阿骨打的率领下起兵反辽，1115年完颜阿骨打在会宁府（今黑龙江省哈尔滨市阿城区）正式建都立国，国号大金。1125年金国灭辽，整个东北地区完全被金国掌控。
1234年蒙古灭金后在东北以及今天俄罗斯远东地区设辽阳行省。元末纳哈出成为辽阳行省的实际统治者。元顺帝北逃后以纳哈出手握重兵，封其为丞相，继封太尉。不久元辽阳行省平章刘益降明，辽东大部为明所有，纳哈出领兵踞开元路（今开原），屯兵二十万于金山（今昌图金山堡以北至辽河南岸的吉林双辽东北一带），与明军对峙。
明太祖朱元璋多次遣使招抚，纳哈出不仅置之不理并于洪武八年（1375）入犯辽东，兵锋直达金州。洪武二十年冯胜率大军二十万于金山战胜纳哈出，见大势已去的纳哈出这才归顺于明，东北地区由此纳入明王朝的版图。明永乐九年（1411年）至宣德八年（1433年）的20余年中明朝派遣海西女真出身的宦官亦失哈出使黑龙江下游地区，在此设置奴儿干都司。
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