南京大学各个学科均有国内一流的师资队伍。现拥有中国科学院院士29人，中国工程院院士4人，第三世界科学院院士4名，俄罗斯科学院院士1名，973计划和重大科学研究计划项目首席科学家9人，教育部“长江学者奖励计划”特聘教授、讲座教授59人，国家级有突出贡献的中青年科学、技术、管理专家和杰出青年基金获得者93人，国家级教学名师7人。
以上数据均位居全国高校前列。 10余年来，南京大学共获国家级和省部级奖励800余项，其中国家自然科学奖、国家科技进步奖、国家技术发明奖40余项。2006年，南京大学闵乃本院士获得国家自然科学一等奖，这是我国自然科学界科研成果的最高奖项，也是自1999年国家奖励制度改革以来内地高校独立完成的首个国家自然科学一等奖。
据统计，自1997年至今被授予自然科学领域国家最高奖的5项成果中，有3项的完成人或第一完成人是南大校友。国务委员陈至立和刘延东都曾高度称赞南京大学是“最适宜做学问的大学”。 特色鲜明 教学卓越 2008年4月，南京大学以19个二级指标全优的成绩顺利通过了教育部组织的本科教学水平评估，在全部44个评估观测点中，有43个取得了A级评价。
学校认真实施教育部“本科教学质量与教学改革工程”，总体建设情况名列综合大学第三，建成了国家级精品课程42门，国家级教学团队6个;获选国家级特色专业建设点13个、国家级人才培养模式创新实验区5个，国家级教学名师7人;拥有国家基础学科人才培养基地12个，国家生命科学与技术人才培养基地1个，教育部人文社会科学重点研究基地4个。
南京大学以培养未来各行各业创新拔尖的领军人才为目标，逐步形成了“学科建设与本科教学融通，通识教育与个性化培养融通，拓宽基础与强化实践融通，学会学习与学会做人融通”的人才培养思路。面向2009级新生，南京大学将全面启用“个性化、多元化人才培养新方案”。在招生录取中，采取按院(系)和专业类招生，学生在专业分流与专业选择中具有更多的自主权;将人才培养分为大类培养、专业培养、方向性培养三个阶段，构建出“通识教育 宽口径专业培养”新模式;课程开放度大大提高，由院士、教学名师等担任主讲的数十门小班教学新生研讨课和30余门高水平通识教育课程，完善学生知识结构和能力素质;为专业学术性、跨学科复合型和就业创业型分别设计不同的培养方案，人性化与多元化并举的培养理念与国际接轨。
交流活跃 迈向国际 南京大学是国际交流合作最活跃、成效最显著的高校之一。与世界30多个国家和地区的230个高校和相关机构建立了合作交流关系，其中包括与哈佛大学等50多所世界一流大学及20多所世界500强企业和基金会结成紧密型合作伙伴。开设了20余个长期学生交流项目，每年派出学生600余人次。此外，还有暑期交流等短期项目，为更多的学生创造了接触世界各地文化的机会。
始建于20世纪80年代的南京大学-霍普金斯大学中美文化研究中心迄今已成功举办二十多年，它是中国改革开放以后最早实施的高等教育国际合作长期项目，为中美文化交流事业培养了众多骨干人才，在海内外产生了巨大的影响。目前，南京大学还合作创办了中加学院、南京-纽约学院、南京大学———南安普敦大学联合中心，采用2 2或3 X的联合培养模式合作培养本科生。
南大仙林国际化校区的建设更是南大国际化办学历史上又一个里程碑。仙林校区地处南京国际高教园区，校区首批建设的中外合作机构就有：与美国纽约州立大学合办的南京纽约学院，与加拿大滑铁卢大学合办的中加学院，与英国南安普敦大学共建的“南京大学-南安普敦大学联合中心”，与美国、法国、德国有关高校及科研机构合建的“南京大学公共卫生与健康医学合作研究中心”，与法国巴黎第十二大学合建的“中法城市与区域科学研究中心”，与德国哥廷根大学合办的“中德法学研究所”，与法国航天局等合作的“中法合作太阳爆发探测小卫星研究中心”等。
南京大学还积极实践“走出去”的战略。去年年底，学校在法国阿尔多瓦大学成立孔子学院，这也是从2007年1月以来，继英国谢菲尔德大学孔子学院、澳大利亚墨尔本大学孔子学院、加拿大滑铁卢大学孔子学院、美国爱默里大学孔子学院后的第五所。同时，学校与德国弗莱堡大学、智利天主教大学共建的孔子学院也正在实施中，这些合作大学大都是全球200强名校。
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