可以说这一时期的谷王朱橞，确实为巩固大明北方疆域、防御外敌入寇，做出了一个边塞亲王应有的贡献。洪武三十一年（1398年）闰五月，明太祖朱元璋驾崩，皇太孙朱允炆奉遗诏登基，即建文帝。之后建文帝用近臣方孝孺、黄子澄、齐泰等的计策，针对诸位手握重兵的叔父展开“削藩令”，先后废黜周王朱橚、代王朱桂、齐王朱博、岷王朱楩，湘王朱柏也因此愤而自尽。
在建文帝的咄咄逼人态势下，诸王之中最长的太祖第四子燕王朱棣（其时太祖次子秦王朱樉、三子晋王朱棡已经去世）为自保、也为了拼死一搏，于建文元年（1399年）六月在藩地北平（今北京）发动“靖难”，举兵对抗建文朝廷，和侄子建文帝刀兵相见！燕王朱棣展开“”靖难之役”后，依仗丰富的作战经验、连续击败北平附近驻守的南军，席卷北平、永平、蓟州等地，声势浩大。
为避免比邻燕藩的宁藩、谷藩、辽藩或投靠燕王、或被燕军击败擒获，建文帝下诏让宁王朱权、谷王朱橞、辽王朱植“率护卫南下勤王”，其实也有把他们召回京师（南京）就近控制的意思。得到建文帝诏书的辽王朱植马上率护卫和内眷乘海船南下，赴京师“勤王”。而宁王朱权却拒不接受，以情况未明、藩地不稳等理由不肯南下，建文帝大怒，诏令削去朱权王爵，废为庶人，以示惩戒（当然，朱权人在大宁卫，朝廷的诏书对他现在没有任何约束意义，以后怎么不好说）。
而谷王朱橞的藩地宣府距离北平只有三百里，咫尺之遥，燕军如果西征，旦夕可至。朱橞当年只有二十岁，年轻无经验，根本无法单独面对这种家族内讧所引起的复杂局面。于是，在比自己还大两岁的侄子建文帝朱允炆“南下勤王”的诏书抵达宣府后，如释重负的朱橞立即接受谕旨，率三千近卫及家眷在建文元年（1399年）七月二十四匆匆逃离宣府，南下京师，“勤王”朝廷。
离开宣府前，朱橞还特别安排留守诸将把宣府城宣德、承安、高远三门封死，只留东南一门，以便固守，抵挡可能前来的燕军。从这里可以看出，这时候的朱橞，依旧还是忠于朝廷，支持侄子建文帝，忠义之心尚存。抵达京师（南京）后的朱橞被建文帝大加赞赏，褒奖忠诚之心。不过之后建文帝并没有让朱橞担任过什么重要的职责，“勤王”之名不过是怕他被燕王蛊惑、参与“靖难”，或者直接被燕王胁迫，导致谷藩精锐尽入燕军之手罢了（宁王朱权，就是这样，半胁迫半蛊惑地加入了燕军阵营中）。
朱橞在京师三年，一直无所事事，待遇优厚而实权全无，以亲王之尊打了三年酱油，心情可想而知。对于建文帝及朝廷的不满和埋怨日益增长。建文四年（1402年）六月，历时三年的“靖难之役”即将分出胜负，燕军在年初接连击败南军主力，势如破竹，大举南下，已经渡过长江，围攻京师（南京）。无计可施的建文帝困守城内，无人可用，只得起用赋闲三年的十九叔谷王朱橞，诏令他驻守金川门，抵挡燕王朱棣的大军。
朱橞在京师赋闲三年，无权无势，对于这个侄子皇帝早就腹诽已久，怨恨不已。此时京师境况危急，燕王的大军已在城外，即将攻城。朱橞本来对守住京师就不报希望，同时四哥朱棣的“靖难”也是为了自己家兄弟的利益，于是他自驻守金川门后，就准备暗中联络四哥朱棣，迎燕军进城。建文四年（1402年）六月十三，燕王朱棣亲率大军抵达金川门外，驻守的谷王朱橞远远望见朱棣的亲王麾盖仪仗，于是立即打开金川门，亲自出城迎接燕王入京。
燕王对于这个多年不见的十九弟主动献城门的举动欣喜不已，大笑着与朱橞携手在重重护卫的保护下策马进入金川门。由于朱橞的主动投降，燕军得以未经血战就轻松破城，进入京师，历时三年的靖难之役终以燕军获胜而告终。朱橞献门之后，大势已去的建文帝朱允炆于乱军中失踪，建文朝廷覆灭。燕王朱棣在参拜了孝陵（太祖陵寝）之后即位，即大明第三代皇帝明太宗（成祖）。
成祖有鉴于谷王朱橞献门有功，登基后特地给谷藩增加禄米二千石，又在谷藩原有护卫员额之上增加再三千军士，并赐以鼓、乐，厚加恩遇。之后，在朱橞本人的请求下，成祖将谷藩自宣府这个北方边境军事险要之地改封内地鱼米之乡，移藩到湖广长沙府。朱橞在关键时刻抛弃建文帝，投靠成祖，立下“迎驾大功”，所以自恃有大恩于成祖，所作所为日渐骄横霸道。
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