佐助轮回眼和长门轮回眼的差异并不是在于佐助的轮回眼和六道仙人有关系，而是在能力上有差别。那么，为什么佐助有将轮回眼移植给卡卡西的这个想法呢？】佐助赴死：轮回眼必成最大的隐患轮回眼的隐患，在第四次忍界大战中，已经明显体现出来了。这也就导致了佐助的轮回眼为什么跟斑与六道仙人的轮回眼不一样的且只能开一只轮回眼的缘故。
佐助为什么不能开启双轮回眼？
在疾风传里第一个能够开启轮回眼的是宇智波斑。后面长门所拥有的轮回眼也是来自于他。而之后，第二个拥有轮回眼的便是佐助。但是注意的是，佐助的轮回眼并不是靠自己开启的，而是依靠六道给与的阴之力，使得佐助的左眼成为轮回眼，而且还是六勾玉的轮回眼。不过宇智波斑能够开启轮回眼靠的却是自己，不过无论如何不借助外界的力量也是无法得到。
那是因为得到了柱间的细胞，想千手和宇智波的力量融合在一起，因此，就相当于得到类似六道的力量，而且开启了双轮回眼，实力一点不比佐助的轮回眼差。那么为什么佐助得到的只是一只轮回眼呢？当然这其中也有剧情的因素，想一想当初宇智波斑得到的两个轮回眼的时候，再加上十尾的力量，实力可谓是到了变态的程度。就算鸣人佐助联手对抗他也显得非常吃力，而且凯皇开启了八门遁甲，但最后就算打到死也没有彻底伤到六道斑，在忍界之内可谓再无敌手。
而且拥有两只轮回眼的宇智波斑战斗力也是成倍增长。而且佐助原本的写轮眼，最多也就是对于天照的控制，和轮回眼比起来根本不算什么。那么照这样来看，当初鸣佐决战的时候，如果佐助拥有了两只轮回眼，再加上九大尾兽的力量，鸣人根本就打不过。因此，出于这样的考虑，还是让佐助只有一只轮回眼才更好一些。况且轮回眼的开启也不是那么容易，需要拥有六道阴阳之力。
但是当时佐助得到的只是阴之力，而阳之力给予的鸣人。因此佐助才只拥有了一只轮回眼。不过要获得这种力量，还有一个办法，那就是柱间的细胞。如果在万花筒的基础之上，再移植上柱间的细胞，就可以具备开启双轮回眼的力量，就像宇智波斑那样。不过佐助也是有这样的机会的，在最后决战过后，他和鸣人都断了一只手臂。要使它是能够有机会移植柱间细胞的。
为什么佐助的轮回眼和长门的不一样？
哈哈，这个问题有意思了，为啥佐助的轮回眼和长门不一样?个人认为最主要的区别在于佐助的轮回眼具有空间转移能力，因此在综合能力上比斑的要强一些。而斑的轮回眼并没有空间转移能力，因此也没有勾玉。下面具体说明一下。火影中有勾玉的轮回眼才具有空间转移能力，斑的轮回眼没有空间转移能力，因此和佐助的轮回眼有差异。如果各位对于火影忍者中轮回眼的能力进行过仔细的观察就会发现不同轮回眼持有者的能力是不同的，这一点与写轮眼在火影中的设定类似，轮回眼除了基本的吸收忍术，神罗天征，万象天引和地爆天星这些能力以外还有一些附加的能力，空间转移能力就是其中的一种。
目前已知出现过的具有空间转移能力能力的轮回眼持有者是大筒木辉夜，宇智波佐助和大筒木浦式，其余的像六道仙人，大筒木桃式，宇智波斑这些轮回眼持有者都不具备空间转移能力。很多人说斑有轮墓这种技能啊，但是斑的轮回眼确实没有像辉夜这种可以在多个异空间来回切换的能力。而长门的轮回眼是移植于斑的轮回眼，因此在能力上和佐助的轮回眼是有差异的。
长门只能使用轮回眼的基础能力，同样不具备空间转移能力，所以长门的轮回眼也就没有勾玉了。佐助轮回眼和长门轮回眼的差异并不是在于佐助的轮回眼和六道仙人有关系，而是在能力上有差别。佐助的勾玉轮回眼可以使用强大的空间转移能力。但是长门的轮回眼只能使用轮回眼的基本能力，缺乏空间转移能力。大筒木辉夜同样可以使用空间转移能力，因此辉夜的轮回眼也带有勾玉。
长门的轮回眼没有异空间转移能力，因此也就没有勾玉了。由于斑的设定太强，因此佐助的轮回眼必须有特殊的能力才能对抗具有轮回眼的斑。后期获得双轮回眼的斑实力异常强大，而获得六道力量的鸣人和佐助也只是和斑旗鼓相当而已，没有太明显的优势。这个时候岸本想要快速完结火影，怎么办呢？只能给佐助的轮回眼设计一个特殊的技能，就是天手力。
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