最后，商鞅在变法过程中，执法不避权贵、刑上大夫，排除一切阻力，坚决贯彻了法家的变革主张，虽难度极大，但他仍然坚持着。若没有商鞅坚定而执着的努力，秦国不可能那么快强大起来。商鞅（剧照）变法实际上是对旧制度进行变革，是对各阶层利益的重新分配，而商鞅变法的一项根本性的内容就是施行“奖励耕战，实行军功爵制”的政策，这一政策打破了延续几百年的贵族世袭制，为平民进入上层阶层打开了通道。
这一政策的最大有利之处就是激发了秦国民众积极生产、积极参战的活力，使秦国的经济和军事力量日益强大；但是，商鞅也因为打破了世袭制，侵犯了秦国旧贵族的根本利益而得罪了贵族势力。而且，商鞅在秦孝公病重期间，独揽军政大权，在旧贵族看来，这就是专权擅政，此时，秦孝公又没有精力再支持商鞅，致使朝中的权力斗争不断激化，并往不利于商鞅的方向发展。
因此，在秦孝公死后，旧势力开始反扑，公子虔等旧贵族势力代表，罗织商鞅的罪名，诬告其谋反，秦惠文王继位之后，为了稳固皇权，不得不对强势的旧贵族作出妥协，同时，也是为了夺取商鞅的军政大权，便依靠旧贵族的势力，下令追捕商鞅。商鞅逃亡至边关，欲寄宿于客舍，但因客舍主人不知他是大良造，见他未带凭证，所以，依商鞅之法，欲将想留宿而无凭证的商鞅之客抓起来交官方治罪，商鞅没有办法，便逃往魏国，但魏国官员却因为商鞅曾使诈骗擒过公子卬，拒绝商鞅入魏境。
商鞅只好回到秦国，潜回他的封邑商於，并在商於发动邑兵攻打郑县（今陕西省渭南华县），秦惠文王派兵征伐商鞅，商鞅在彤地（今陕西省渭南市华州区西南）因战败而死，商鞅的尸身被带回咸阳，处以车裂后示众，秦惠文王还下令诛灭商鞅全家。值得注意的是，商鞅虽然被车裂了，但是他所推行的新法并未被秦惠文王所废除，可以说，在秦惠文王的内心里，并没有认为商鞅变法是错误的，变法逐渐使秦国富国强兵，对此，秦惠文王内心是很明白的。
商鞅对于秦孝公时期的秦国，至少有三大贡献：其一，商鞅提出了全面激励农业发展的经济政策，他颁布了《垦草令》，制定出二十种重农和开垦荒地的激励措施，打击工商业，利用奖励刺激农业发展。其二，商鞅推行重刑厚赏的政策。在商鞅看来，人的本性是趋利畏罪的，只要重刑厚赏，便可治理好民众，使国家安定。商鞅制定了严酷的刑法，严格推行，不允许有任何违法行为发生；同时，他对于有功者实行重赏，从不失信，功必获赏，完全兑现。
其三，商鞅推行一系列重战尚武措施，主张全民皆兵，不管是高层的贵族还是底层的士卒，无功者不得获赏封爵，而有功者必赏，有大功者根据军功可获封相应的爵位。对于商鞅的这些政策主张，秦国的君王是支持的，因为这些政策对秦国的强大有非常大的益处，秦孝公活着的时候竭力支持商鞅，而秦惠文王即位之后，在内心里也是支持商鞅变法的。
商鞅的变法政策主张已成了秦国基本的治国方略。致使商鞅被车裂的原因主要有两项：一项是公子虔等贵族势力的反扑，因为商鞅的变革严重地触犯了旧贵族的利益，使旧贵族失去了原来世袭制所拥有的种种好处，贵族势力因变法而被压制，而平民阶层却能通过建立军功而获得爵位，对此，公子虔是不能容忍的，势必置商鞅于死地而后快。另一项是商鞅在秦孝公病重时所掌握的军政权力太大了，秦惠文王即位之后，为了向贵族势力作出妥协，同时也是为了夺回商鞅手中的军政大权，也需要置商鞅于死地。
商鞅的死虽然是很冤的，但是，商鞅所推行的变革有过激之处，他忽略了对旧贵族势力的分化，树敌太多，这是他陷入绝境的原因之一；其次，他后期所拥有的军政权力太大，有专权擅政之嫌，在朝中的地位太过显赫，这对于刚即位的秦惠文王来说是一个很大的威胁，而皇权意识非常强的秦惠文王是不会容许朝中有如此地位显赫的权臣的，所以，商鞅才会被值得走投无路，并在死后还被处于车裂之刑，全家被诛杀。
商鞅之死给后人的主要启示是：其一，推行变革不能太过激烈，树敌不能太多，阻力太大时要警惕敌对势力的疯狂反扑。要知道，分化敌人，化解阻力对于推行革新是非常重要的；其二，主持政局的大臣要警惕功高盖主之嫌，权力太大了对于君王是一种威胁，而这种威胁是君王所不能容许的，专权擅政，往往下场是很惨的；其三，商鞅所推行的秦法太严酷了，少了仁德方面的配套管理措施，结果，严法酷刑最后落到了商鞅自己的身上，这叫“自得其所”，实在不该！第二，李斯在秦朝的危机之时，干了一件非常不地道的事，他在宦官赵高的胁迫下，与赵高联手，发动了“沙丘之变”，他们合谋篡改了始皇的传位诏书，废太子扶苏，改立胡亥为新帝，致使秦朝早亡。
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